MRI（磁共振成像）在鉴别肝脏结节方面灵敏度和准确性都很高。使用肝细胞特异性对比剂Gd-EOB-DTPA增强MRI检查≤2cm的肝硬化结节时，敏感度能达到96.6%，特异性为92.7%；MRI增强扫描对高级别异型增生结节（HGDN）的鉴别也很精准，灵敏度为94.7%，特异性高达99.3%，能较准确地分辨早期肝癌和HGDN。
不过，MRI不太适合用于大规模人群的肝癌筛查，更适合作为加强筛查或早期肝癌影像学诊断的手段。早期筛查时，优先推荐FibroScan福波看的定量超声诊断检查，它能评估肝脏纤维化程度，方便提前采取措施干预。使用aMAP等基于容易获取的临床指标构建的肝癌风险评分系统来预测风险；超声检查（US）是首选的影像学检查方法，而甲胎蛋白（AFP）检测联合超声检查可以提高早期肝癌的检出率。
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